Volná místa

Hledáme bioinformatika!

• Provádění analýzy NGS dat z různých přístrojových platforem (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio) a pro různé NGS aplikace (genom, mikrobiom, metagenom, exom, transkriptom atd.).
• Návrh řešení pro specifická zadání, vlastní analýza dat a její následná automatizace.
• Vývoj bioinformatických postupů pro analýzu sekvenačních dat.
• Tvorba a správa databází a reportů.
• Tvorba a rozvoj infrastruktury pro analýzu dat.

Požadavky:

• VŠ - bioinformatika a biostatistika, popř. přírodní vědy s bohatou zkušeností v oblasti bioinformatiky
• Zkušenosti s velkými objemy biologických dat
• Znalost programovacích jazyků R, python a bash/shell.
• Znalost text miningu a data miningu výhodou
• Aktivní znalost s open source nástroji pro zpracování NGS dat (například GATK, Trinity, Trinonate, Qiime2, BWA, Bowtie, TopHat, STAR, SPAdes, apod.)
• Znalost workflow management systemů výhodou (Snakemake, Nextflow, apod.).
• Znalost laboratorních technik Next generation sekvenování a praktická laboratorní zkušenost výhodou
• Schopnost pracovat samostatně, pečlivě, aktivně a zodpovědně na svěřených úkolech
• Excelentní komunikační a prezentační schopnosti, znalost angličtiny slovem i písmem

Nabízíme:

• Práce v menší soukromé firmě
• Flexibilní pracovní doba, možnost práce na částečný úvazek, částečně z domova nebo formou externí spolupráce
• Finanční ohodnocení dle sjednané délky pracovní doby, zkušeností a výkonu
• Možnost odborného vzdělávání a rozvoje, pravidelná školení
• Místo výkonu práce: Dobříš, home office
• Nástup: kdykoliv