Alokace se odvíjí od celé řady faktorů např. počtu vzorků, průměrné délky fragmentů, celkové délky sekvenované oblasti, požadované hloubky čtení apod. Nelze dát obecné doporučení. Pokud si nejste jisti, kontaktujte nás, nebo navštivte náš kurz Základy Next-generation sekvenování.
Vzhledem k tomu, že naše vzorky jsou velmi specifické (nekultivovatelné RNA viry), bylo nutné vytvořit vlastní postup. Při tomto s námi firma SEQme úžasně spolupracovala, takže hned zpracování prvního zkušebního vzorku bylo úspěšné. V každém případě mohu firmu SEQme doporučit jak pro rutinní vyšetřování vzorků pomocí sekvenace, tak pro náročnější projekty vyžadující modifikované postupy. Jsou velmi pružní a kreativní.
Romana
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, Brno