Vzorek je templát smíchaný v jedné zkumavce / jamce se sekvenačním primerem, nebo templát samotný, pokud požadujete některý z našich univerzálních primerů. Templát je PCR produkt nebo plazmid.
Počet objednaných vzorků = počet zaslaných zkumavek nebo počet obsazených jamek destičky.
Veškeré templáty musí být přečistěny (plazmidy např. na kolonkách či jinou běžnou metodou kompatibilní se sekvenováním, PCR produkty např. enzymaticky pomocí Exo-SAP či jiným způsobem) nebo alespoň přesráženy etanolem a rozpuštěny ve vodě (HPLC-kvality). Rozpouštění v pufrech (TE apod.) spíše nedoporučujeme.
Pokud používáte vaše vlastní primery, smíchejte:
Templát |
Množství |
Váš primer |
Celkový objem |
PCR produkt <500 bp |
50 ng |
Přidejte 25 pmol vašeho primeru (5 μl 5 μM roztoku primeru) |
10 μl |
PCR produkt 500–1000 bp |
100 ng |
||
PCR produkt >1000 bp |
200 ng |
||
Plazmid |
500 ng |
Chcete-li použít naše univerzální primery, připravte templát takto:
Templát |
Množství |
Celkový objem |
PCR produkt <500 bp |
50 ng |
5 μl |
PCR produkt 500–1000 bp |
100 ng |
|
PCR produkt >1000 bp |
200 ng |
|
Plazmid |
500 ng |
Pokud nemáte požadované množství templátu k dispozici, můžete snížit celkový objem zasílaných vzorků při dodržení koncentrace templátu i primeru. Např. pokud máte k dispozici pouze 30 ng PCR produktu o velikosti 400 bází, použijte 3 μl tohoto templátu a 3 μl 5 μM roztoku primeru. Celkový objem v tomto případě bude 6 μl. Upozorňujeme, že v takovýchto případech nemůžeme garantovat opakování sekvenace v případě, že první sekvenační reakce z jakýchkoliv důvodů selže.
Minimální celkový objem templát + primer, který můžete zaslat, jsou 4 μl.
Doporučujeme používat 8-zkumavkové stripy s individuálními víčky (např. Eppendorf 0030124359) nebo 96-jamkové destičky. Nepoužívejte parafilm. Prosíme o jednoduché značení zkumavek nejlépe číslem označujícím pořadí vzorku v objednávce.