Návody a dotazy

Pokyny pro přípravu vzorků na DNA metabarcoding - Paralelní sekvenování amplikonů (pouze Illumina)

Dodržujte naše Pokyny pro přípravu vzorků.

  • Vzorky musí být po první PCR přečištěny a dodány přesně v koncentraci dle návodu. Příliš nízká koncentrace by mohla vést k nízkému výtěžku PCR, vysoká koncentrace k rozdílným výtěžkům nebo i inhibici reakce (vysoká koncentrace DNA může být spojena s vysokou koncentrací inhibitorů). Vzorky prosím dodávejte ve stripech nebo 96-jamkových destičkách.
  • Je nezbytně nutné, aby vzorky byly opatřeny přesahy, rovněž musí být odstraněny přebytečné primery nebo adaptéry, zbytky enzymů atd.
  • Celková délka fragmentů DNA musí být mezi 200 a 900 bp!

Jak navrhnout primery

Připojte na 5’ konce vašich primerů: 

  • Forward: 5’ TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-[specifická sekvence]
  • Reverse: 5’ GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-[specifická sekvence]

Krok 1 ve vaší laboratoři

Provedete PCR amplifikaci cílových oblastí a smíchání všech amplikonů ze stejného vzorku do jednoho poolu.

Krok 2 v SEQme laboratoři

Provedeme druhou PCR, v níž k vašim amplikonům přidáme indexy a sekvenační adaptéry. Takto zpracované vzorky jsou následně sekvenovány podle vašich požadavků - služba je z hlediska výstupu flexibilní.


 

Zpět na seznam
© SEQme s.r.o., 2012 - 2024. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
Webdesign Vibes Vision