Sangerovo sekvenování je technika volby v situaci, kdy potřebujete zjistit nukleotidovou sekvenci jednotlivých fragmentů DNA, nejčastěji vektorových konstruktů nebo PCR amplikonů. Je založena na separaci fluorescenčně značených produktů sekvenační reakce pomocí kapilární elektroforézy v závislosti na jejich molekulové hmotnosti.
Nabízíme tyto protokoly Sangerova sekvenování:
- StandardSeq - Jedná se o nejběžnější protokol v naší nabídce Sangerova sekvenování. Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).
- RapidSeq - Nejrychlejší protokol v naší nabídce Sangerova sekvenování. Vzorky pro protokol RapidSeq jsou v sekvenátorech analyzovány přednostně a jejich výsledky vyhodnocovány automaticky. První výsledky tedy můžete čekat asi po 10 hodinách od doručení vzorků.
- ColonySeq - Sekvenování plazmidů přímo z bakteriálních kolonií a kultur, jako templát nám tedy zasíláte alikvot kultury nebo bakteriální kolonii vypíchnutou z agarové plotny.
- CleanSeq - Sekvenování PCR produktů, jehož součástí je enzymatické přečištění. Zasíláte nám tedy templát, který není připraven na vlastní sekvenaci a musí být nejprve přečištěn.
- HairpinSeq - Speciální protokol pro sekvenování problematických templátů. Součástí protokolu je obousměrná sekvenace. Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).
Vyhodnocení výsledků:
S výjimkou protokolu RapidSeq provádí naši specialisté vyhodnocení výsledků ručně! Každý výsledek je před odesláním kontrolován a podle potřeby znovu analyzován, abychom z něj pro vás dostali maximum možného. Doporučujeme Vaší pozornosti články v našem Blogu, kde se průběžně věnujeme různým aspektům této metody včetně vyhodnocování výsledků.
Pro všechny protokoly můžete očekávat:
- Délku čtení až 1100 bp, přesnost čtení typicky > 99%
- Zdarma poskytnuté univerzální primery
- Výsledky on-line ve formátu .ab1, fasta a .phd.1
- Automatické zaslání emailu jakmile jsou výsledky k dispozici
- Neustálou interní kontrolu kvality
- Uchování vašich vzorků jeden týden, vašich výsledků dva roky
- Kvalifikovanou technickou podporu
Srovnání našich sekvenačních protokolů - ke stažení ZDE.
StandardSeq
Standardní sekvenační protokol pro běžné templáty - plazmidy a pcr produkty. Templát musí být smíchaný se sekvenačním primerem, pokud není objednána sekvenace s univerzálním primerem.
RapidSeq
Rychlý sekvenační protokol pro běžné templáty - plazmidy a pcr produkty. Templát musí být smíchaný se sekvenačním primerem pokud není objednána sekvenace s univerzálním primerem.
ColonySeq
Sekvenování plazmidů přímo z bakteriálních kolonií a kultur, jako templát nám tedy zasíláte alikvot kultury nebo bakteriální kolonii vypíchnutou z agarové plotny.
CleanSeq
Sekvenování PCR produktů včetně jejich enzymatického přečištění. Templátem je nepřečištěný PCR produkt.
HairpinSeq
Speciální protokol na vlásenky, GC-bohaté a další problematické sekvence. V ceně je obousměrná sekvenace! Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).