Sangerovo sekvenování je technika volby v situaci, kdy potřebujete zjistit nukleotidovou sekvenci jednotlivých fragmentů DNA, nejčastěji vektorových konstruktů nebo PCR amplikonů. Je založena na separaci fluorescenčně značených produktů sekvenační reakce pomocí kapilární elektroforézy v závislosti na jejich molekulové hmotnosti.

Nabízíme tyto protokoly Sangerova sekvenování:

  • StandardSeq - Jedná se o nejběžnější protokol v naší nabídce Sangerova sekvenování. Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).
  • RapidSeq - Nejrychlejší protokol v naší nabídce Sangerova sekvenování. Vzorky pro protokol RapidSeq jsou v sekvenátorech analyzovány přednostně a jejich výsledky vyhodnocovány automaticky. První výsledky tedy můžete čekat asi po 10 hodinách od doručení vzorků.
  • ColonySeq - Sekvenování plazmidů přímo z bakteriálních kolonií a kultur, jako templát nám tedy zasíláte alikvot kultury nebo bakteriální kolonii vypíchnutou z agarové plotny.
  • CleanSeq - Sekvenování PCR produktů, jehož součástí je enzymatické přečištění. Zasíláte nám tedy templát, který není připraven na vlastní sekvenaci a musí být nejprve přečištěn.
  • HairpinSeq - Speciální protokol pro sekvenování problematických templátů. Součástí protokolu je obousměrná sekvenace. Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).

Vyhodnocení výsledků:

S výjimkou protokolu RapidSeq provádí naši specialisté vyhodnocení výsledků ručně! Každý výsledek je před odesláním kontrolován a podle potřeby znovu analyzován, abychom z něj pro vás dostali maximum možného. Doporučujeme Vaší pozornosti články v našem Blogu, kde se průběžně věnujeme různým aspektům této metody včetně vyhodnocování výsledků.

Pro všechny protokoly můžete očekávat:

  • Délku čtení až 1100 bp, přesnost čtení typicky > 99%
  • Zdarma poskytnuté univerzální primery
  • Výsledky on-line ve formátu .ab1, fasta a .phd.1
  • Automatické zaslání emailu jakmile jsou výsledky k dispozici
  • Neustálou interní kontrolu kvality
  • Uchování vašich vzorků jeden týden, vašich výsledků dva roky
  • Kvalifikovanou technickou podporu

Srovnání našich sekvenačních protokolů - ke stažení ZDE.


StandardSeq

Standardní sekvenační protokol pro běžné templáty - plazmidy a pcr produkty. Templát musí být smíchaný se sekvenačním primerem, pokud není objednána sekvenace s univerzálním primerem.

RapidSeq

Rychlý sekvenační protokol pro běžné templáty - plazmidy a pcr produkty. Templát musí být smíchaný se sekvenačním primerem pokud není objednána sekvenace s univerzálním primerem.

ColonySeq

Sekvenování plazmidů přímo z bakteriálních kolonií a kultur, jako templát nám tedy zasíláte alikvot kultury nebo bakteriální kolonii vypíchnutou z agarové plotny.

CleanSeq

Sekvenování PCR produktů včetně jejich enzymatického přečištění. Templátem je nepřečištěný PCR produkt.

HairpinSeq

Speciální protokol na vlásenky, GC-bohaté a další problematické sekvence. V ceně je obousměrná sekvenace! Zasíláte nám templát, který je připraven na vlastní sekvenaci (přečištěn).