Alokace se odvíjí od celé řady faktorů např. počtu vzorků, průměrné délky fragmentů, celkové délky sekvenované oblasti, požadované hloubky čtení apod. Nelze dát obecné doporučení. Pokud si nejste jisti, kontaktujte nás, nebo navštivte náš kurz Základy Next-generation sekvenování.

Kdy využít celou dráhu / flowcellu a kdy využít ShareSeq datové balíčky?

Způsob zpracování vzorků je v obou případech totožný. Primárně jsou ShareSeq datové balíčky vhodné pro projekty malého až středního rozsahu, kdy je vyžadována poměrně nízká sekvenační kapacita na vzorek a nevyplatí se hradit sekvenování na celé dráze. Současně velmi doporučujeme ShareSeq i v případech, kdy provádíte velké a nákladné sekvenační projekty a chcete si předem něco otestovat - např. úspěšnost ribo-deplece či jiného způsobu nabohacení specifické frakce genomu/transkriptomu, míru mapování na referenční sekvenci, výskyt očekávaných organismů atp.

V případě datových balíčků ShareSeq budou vaše vzorky analyzovány společně se vzorky jiných klientů. Pokud provádíte sami přípravu knihoven, je naprosto kritické, abyste nám poskytli přesné informace o postupu přípravy, použitých indexech apod. Tyto informace budou požadovány při zadávání objednávky do našeho systému.