Jsme hrdí na to, že poskytujeme komplexní řešení v oblasti Next-Generation sekvenování. Vy víte, co chcete, my víme, jak toho dosáhnout.
Náš tým pro vás provádí:
|
Analýza dat tvoří nedílnou součást našich služeb na poli Next-Gen sekvenování. Naši bioinformatici s vámi prodiskutují vaše cíle a následně analyzují data, a to i v případě, že jste je získali sekvenováním v nějaké jiné laboratoři. Standardní postupy analýzy dat lze rovněž upravit podle vašich specifických potřeb, případně na základě provedené pilotní analýzy.
Váš cíl |
Standardní analýza |
Specifická analýza |
De novo Sequencing
|
De novo assembly
Reference-based genome assembly
|
Gene/ORF prediction
Gene annotation and classification
Variant calling (SNP, INDELs)
|
Whole Genome Resequencing
|
Alignment and summary
Variant calling (SNP, INDELs) and annotation
|
Comparative analysis
Structural variation (CNV) and annotation
|
Exome /Target Sequencing
|
Alignment and summary
Variant calling (SNP, INDELs)
Variant annotation
|
Comparative Analysis
|
Transcriptome Resequencing
|
Transcript mapping
Expression profiles
Differentially expressed genes (DE)
|
Fusion gene analysis
Gene set analysis
Variant calling and annotation
Comparative analysis
|
Transcriptome De Novo Sequencing
|
Sequencing data correction
Transcriptome de novo assembly
Annotation (GO)
|
Differentially expressed genes
Annotation (GO), visualization
Variant calling and annotation
|
smRNA Sequencing
|
Expression profiles
Prediction of known and novel smRNA / miRNA
|
Differentially expressed miRNA
Gene set analysis
Comparative analysis
|
Metagenome Sequencing
|
Contig assembly
OTU clustering and classification
Alignment and summary
|
Gene prediction
Prediction of functionality of each gene candidate
Statistical analysis
|
Epigenome Sequencing
Global methylation profiles
|
Specific methylation profiles
Differentially methylated regions (DMR)
|
DMR-associated genes
Gene set analysis
Comparative analysis
|
Navštivte naše Bioinformatické workshopy.
Poplatky za naše bioinformatické služby jsou účtovány na základě sazeb odvozených od doby trvání spolupráce - od poplatků za krátkodobé či jednorázové bioinformatické úkony až po poplatky účtované při dlouhodobé spolupráci na projektech velkého rozsahu. Jsou založeny na době potřebné pro provedení sjednaných bioinformatických úkonů (sazba na hodinu, den, týden, měsíc) a zahrnují i potřebnou výpočetní kapacitu. V případě zájmu nás kontaktujte, dle rozsahu vašeho projektu jsme schopni poměrně přesně dopředu odhadnout potřebnou dobu realizace / náklady na analýzu. Vy víte, co hledáte. My to umíme najít. Zaslat dotaz - poptávku můžete zde. |