Návody a dotazy

Fragmentační analýza - Jak připravit vzorky

Pozn.: Pod název fragmentační analýza je zahrnováno celé spektrum technik, které mohou mít odlišné způsoby přípravy vzorků (mikrosatelitní analýza, AFLP, RFLP, MLPA, genotypizace systémem SNaPshot, apod.). Níže uvedený návod je tedy obecný. V případě specifických dotazů či požadavků nás prosím kontaktujte.

 

Vzorek je typicky PCR produkt nebo směs PCR produktů, které jsou fluorescenčně značené. PCR produkty nemusí být přečistěné, většinou plně postačí, pokud zašlete alikvot PCR reakce.

Standardně pracujeme se značením pomocí těchto kombinací barev:

Barevná sada

Fluorescenční barvy pro značení vašich produktů

Velikostní standard a jeho rozsah

Poznámka

Objem vzorku

DS-33

6-FAM™, VIC®, NED™, PET®

GeneScan™-600 LIZ® (Life Technologies, kat. č. 4408399), 20-600 bp nebo GeneScan™-1200 LIZ® (Life Technologies, kat. č. 4379950), 20-1200 bp

Velikostní standard dodáme zdarma

Do poznámky v objednávce můžete připsat, jaký objem vzorku máme pro separaci použít (standardně analyzujeme 1 μl)

PowerPlex® 5-Dyes

Fluorescein, JOE, TMR-ET, CXR-ET

Dle vaší volby, značený barvou WEN (dříve CC5 - změna na straně výrobce)

Velikostní standard nám musíte dodat

Před zasláním první várky vzorků nás kontaktujte

 

Pro značení PCR produktů použijte vámi zvolenou kombinaci fluorescenčních barev. Barvy nelze vzájemně kombinovat mezi sadami, tzn. není možné použít najednou např. barvy VIC® a HEX.

Doporučujeme používat 8-zkumavkové stripy s individuálními víčky (např. Eppendorf 0030124359) nebo 96-jamkové destičky. Nepoužívejte parafilm. Prosíme o jednoduché značení zkumavek nejlépe číslem označujícím pořadí vzorku v objednávce.

Stáhněte si návod v pdf formátu.

Zpět na seznam

Možná si chcete přečíst i:

© SEQme s.r.o., 2012 - 2024. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
Webdesign Vibes Vision