Pozn.: Pod název fragmentační analýza je zahrnováno celé spektrum technik, které mohou mít odlišné způsoby přípravy vzorků (mikrosatelitní analýza, AFLP, RFLP, MLPA, genotypizace systémem SNaPshot, apod.). Níže uvedený návod je tedy obecný. V případě specifických dotazů či požadavků nás prosím kontaktujte.
Vzorek je typicky PCR produkt nebo směs PCR produktů, které jsou fluorescenčně značené. PCR produkty nemusí být přečistěné, většinou plně postačí, pokud zašlete alikvot PCR reakce.
Standardně pracujeme se značením pomocí těchto kombinací barev:
Barevná sada |
Fluorescenční barvy pro značení vašich produktů |
Velikostní standard a jeho rozsah |
Poznámka |
Objem vzorku |
DS-33 |
6-FAM™, VIC®, NED™, PET® |
GeneScan™-600 LIZ® (Life Technologies, kat. č. 4408399), 20-600 bp nebo GeneScan™-1200 LIZ® (Life Technologies, kat. č. 4379950), 20-1200 bp |
Velikostní standard dodáme zdarma |
Do poznámky v objednávce můžete připsat, jaký objem vzorku máme pro separaci použít (standardně analyzujeme 1 μl) |
PowerPlex® 5-Dyes |
Fluorescein, JOE, TMR-ET, CXR-ET |
Dle vaší volby, značený barvou WEN (dříve CC5 - změna na straně výrobce) |
Velikostní standard nám musíte dodat |
Před zasláním první várky vzorků nás kontaktujte |
Pro značení PCR produktů použijte vámi zvolenou kombinaci fluorescenčních barev. Barvy nelze vzájemně kombinovat mezi sadami, tzn. není možné použít najednou např. barvy VIC® a HEX.
Doporučujeme používat 8-zkumavkové stripy s individuálními víčky (např. Eppendorf 0030124359) nebo 96-jamkové destičky. Nepoužívejte parafilm. Prosíme o jednoduché značení zkumavek nejlépe číslem označujícím pořadí vzorku v objednávce.