Při analýze vzorků pomocí Next-Generation sekvenování upřednostňujeme, když nám zasíláte DNA nebo RNA izoláty. Nicméně další možností samozřejmě je, že přípravu knihoven provedete sami a posíláte nám hotové sekvenační knihovny (pouze technologie Illumina). Říkáme jim Ready-to-run knihovny a níže jsou uvedeny naše požadavky pro tuto situaci.

• OBECNĚ: Vámi připravené knihovny musí splňovat podmínky uvedené v dokumentu Pokyny pro přípravu a zasílání vzorků - Sample submission guidelines.
• POOLING: Vámi připravené knihovny musí být dodány jako jeden pool (tzn. vaše knihovny v naší laboratoři nepoolujeme).
• ADAPTÉRY: Jednotlivé dílčí knihovny (subknihovny) musí být opatřeny standardními adaptéry (viz stránky firmy Illumina).
• INDEXY: Vámi připravené knihovny musí být opatřeny duálními indexy (ideálně unikátními duálními indexy) s maximální délkou indexů 8 bazí. V případě požadavku na sekvenaci knihoven se single indexy musíte vždy kontaktovat naši technickou podporu. Musíte nám poskytnout informace o sekvenční diverzitě inzertů a indexů. Při výběru indexů postupujte podle pokynů Illumina Index Adapters Pooling Guide (viz stránky firmy Illumina).
• POZOR: Informace o indexech, použitých při přípravě vašich knihoven, musí být bezchybná! Dojde-li v důsledku poskytnutí nepřesných údajů ke zmaření sekvenace jiných vzorků (jiného klienta, který použil stejný index), můžeme požadovat úhradu nákladů za tuto zmařenou sekvenaci.

Všechny tyto informace je potřeba zadat při vyplňování on-line objednávky buď přímo do připravených formulářů nebo nahráním souboru, který tyto dodatečné údaje obsahuje. K jeho nahrání budete při objednávání vyzváni.

V případě pochybností nás prosím kontaktujte!